基于机群的并行分子动力学裂纹模拟

上海大学学报(自然科学版) ›› 2009, Vol. 15 ›› Issue (2): 164-168.

基于机群的并行分子动力学裂纹模拟

鲁红权,张俊乾

（上海大学上海市应用数学和力学研究所,上海 200072）

收稿日期:2007-11-28 出版日期:2009-04-22 发布日期:2009-04-21
通讯作者: 张俊乾(1963～)，男，教授，博士生导师，研究方向为复合材料力学行为机理及其数值模拟研究. E-mail:jqzhang@mail.shu.edu.cn
作者简介:张俊乾(1963～)，男，教授，博士生导师，研究方向为复合材料力学行为机理及其数值模拟研究.
基金资助:
上海市重点学科建设资助项目(S30106)

Parallel Molecular Dynamics Simulation of Crack on Parallel Clusters

LU Hong-quan,ZHANG Jun-qian

(Shanghai Institute of Applied Mathematics and Mechanics, Shanghai University, Shanghai 200072,China)

Received:2007-11-28 Online:2009-04-22 Published:2009-04-21

摘要/Abstract

摘要：

在探讨并行分子动力学算法的基础上，介绍机群并行分子动力学计算环境的构建.详细说明了在机群并行计算环境下，并行分子动力学计算的编程过程和实现方法.最后以并行分子动力学程序Lammps为例，介绍其在自强3000机群并行计算环境下的安装和使用，并以二维LJ裂纹扩展模拟的实例进行验证，得到一些初步的结果.

关键词: 机群；并行；分子动力学；裂纹；模拟

Abstract:

By discussing the parallel algorithm of molecular dynamics and describing construction of a parallel simulation cluster, the process of parallel molecular dynamics (PMD) programming and its implementation are studied. Installation and application of Lammps, a code of PMD, on the parallel cluster Ziqiang 3000 are introduced. The crack PMD simulation is checked.

Key words: cluster; parallel； molecular dynamics; crack; simulation

中图分类号:

TB 24

鲁红权张俊乾. 基于机群的并行分子动力学裂纹模拟[J]. 上海大学学报(自然科学版), 2009, 15(2): 164-168.

LU Hong-Quan, ZHANG Jun-Qian. Parallel Molecular Dynamics Simulation of Crack on Parallel Clusters[J]. Journal of Shanghai University（Natural Science Edition）, 2009, 15(2): 164-168.